El Hospital Universitario de Cruces es el único centro del Estado que cuenta con certificación infantil y de adultos en unidades de atención integral a pacientes con Enfermedad Inflamatoria Intestinal.
En un acto celebrado en el propio hospital, se ha hecho entrega de esta certificación de excelencia a los responsables de las unidades que atienden a los pacientes que sufren esta dolencia. De esta forma, Cruces se convierte en el único centro hospitalario del país que cuenta con este doble reconocimiento, que es indicativo de la «excelencia» con que se trata a los pacientes de cualquier edad afectados por Enfermedad Inflamatoria Intestinal, por ejemplo enfermedad de Crohn o Colitis Ulcerosa.
En la actualidad Cruces atiende al año a más de 1.400 pacientes en la Unidad de adultos y 40 en la de Pediatría.